La consultation vise la conclusion d'un accord-cadre mono-attributaire à bons de commande sans minimum ni maximum, conformément aux articles 78 et 80 du décret n°2016-360 du 25 mars 2016 relatif aux marchés publics.
Cet accord-cadre a pour objet des services de génotypage et la fourniture de données brutes pour le bénéfice de l'U1162. L'analyse des échantillons est destinée à l'identification de variations constitutionnelles de l'ADN associés à un risque accru de carcinome hépatocellulaire (CHC) dans une population caucasienne avec et sans CHC pour un nombre d'échantillons estimé à 3000 (un par individu).
La technologie qui sera utilisée pour générer les données de génotypage est celle développée par l'entreprise Illumina (Infinimum) ou une technologie au niveau équivalent, ce, afin que l'équipe de recherche puisse réaliser la comparaison des données de génotypage existantes issues de cette technologie avec celles obtenues dans le cadre du présent accord-cadre.
L'unité de recherche fournit les échantillons d'ADN génomique (500 ng maximum avec un minimum de 50 ng/µl pour chaque échantillon) dans de l'eau ou dans un tampon composé de Tris, EDTA. Le titulaire doit accomplir, au minimum, les tâches suivantes et communiquer les résultats au laboratoire de recherche dans les formats spécifiés ci-dessous:
— contrôle de qualité et quantification des échantillons;
— La validation des échantillons et, le cas échéant, un ajustement des concentrations
— La réalisation du génotypage pour l'ensemble des ADN selon la technologie Infinium d'Illumina® ou une technologie équivalente;
— Le contrôle qualité des données validant techniquement chacune des puces
— Le clustering automatique des données;
— L'assignation des allèles
— La fourniture des données brutes (générées par le scanner Illumina® ou par un système aux performances équivalentes);
— La fourniture des fichiers analysés;
— La fourniture de statistique liée au génotypage
Les données générées dans le cadre de l'exécution du présent accord-cadre sont propriété de l'Inserm.